| fastp version: | 1.3.2 (https://github.com/OpenGene/fastp) |
| sequencing: | paired end (153 cycles + 153 cycles) |
| mean length before filtering: | 152bp, 152bp |
| mean length after filtering: | 152bp, 152bp |
| duplication rate: | 1.108426% |
| Insert size peak: | 272 |
| total reads: | 54.820964 M |
| total bases: | 8.354167 G |
| Q20 bases: | 8.022656 G (96.031788%) |
| Q30 bases: | 7.803278 G (93.405819%) |
| Q40 bases: | 0 (0.000000%) |
| GC content: | 48.960941% |
| total reads: | 53.088288 M |
| total bases: | 8.089309 G |
| Q20 bases: | 7.823747 G (96.717133%) |
| Q30 bases: | 7.617541 G (94.168012%) |
| Q40 bases: | 0 (0.000000%) |
| GC content: | 49.001514% |
| reads passed filters: | 53.695360 M (97.946764%) |
| reads with low quality: | 1.091588 M (1.991187%) |
| reads with too many N: | 26.862000 K (0.049000%) |
| reads too short: | 7.154000 K (0.013050%) |
| reads with adapter dimer: | 0 (0.000000%) |
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Adapter or bad ligation of read1
The input has little adapter percentage (~0.019712%), probably it's trimmed before.
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Adapter or bad ligation of read2
The input has little adapter percentage (~0.020184%), probably it's trimmed before.
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Value of each position will be shown on mouse over.
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Darker background means larger counts. The count will be shown on mouse over.
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Darker background means larger counts. The count will be shown on mouse over.
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