| fastp version: | 1.3.2 (https://github.com/OpenGene/fastp) |
| sequencing: | paired end (153 cycles + 153 cycles) |
| mean length before filtering: | 152bp, 152bp |
| mean length after filtering: | 152bp, 152bp |
| duplication rate: | 0.901494% |
| Insert size peak: | 251 |
| total reads: | 57.655198 M |
| total bases: | 8.779682 G |
| Q20 bases: | 8.409395 G (95.782452%) |
| Q30 bases: | 8.177561 G (93.141882%) |
| Q40 bases: | 0 (0.000000%) |
| GC content: | 47.029914% |
| total reads: | 55.875104 M |
| total bases: | 8.507588 G |
| Q20 bases: | 8.211994 G (96.525527%) |
| Q30 bases: | 7.994562 G (93.969781%) |
| Q40 bases: | 0 (0.000000%) |
| GC content: | 47.074604% |
| reads passed filters: | 56.394358 M (97.813137%) |
| reads with low quality: | 1.222794 M (2.120874%) |
| reads with too many N: | 28.036000 K (0.048627%) |
| reads too short: | 10.010000 K (0.017362%) |
| reads with adapter dimer: | 0 (0.000000%) |
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Adapter or bad ligation of read1
The input has little adapter percentage (~0.024755%), probably it's trimmed before.
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Adapter or bad ligation of read2
The input has little adapter percentage (~0.025536%), probably it's trimmed before.
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Value of each position will be shown on mouse over.
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Darker background means larger counts. The count will be shown on mouse over.
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Darker background means larger counts. The count will be shown on mouse over.
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