| fastp version: | 1.3.2 (https://github.com/OpenGene/fastp) |
| sequencing: | paired end (153 cycles + 153 cycles) |
| mean length before filtering: | 151bp, 151bp |
| mean length after filtering: | 151bp, 151bp |
| duplication rate: | 1.536345% |
| Insert size peak: | 152 |
| total reads: | 52.377676 M |
| total bases: | 7.932359 G |
| Q20 bases: | 7.577837 G (95.530694%) |
| Q30 bases: | 7.362693 G (92.818453%) |
| Q40 bases: | 0 (0.000000%) |
| GC content: | 48.086098% |
| total reads: | 50.319212 M |
| total bases: | 7.618679 G |
| Q20 bases: | 7.338343 G (96.320406%) |
| Q30 bases: | 7.138886 G (93.702417%) |
| Q40 bases: | 0 (0.000000%) |
| GC content: | 48.077336% |
| reads passed filters: | 51.122898 M (97.604365%) |
| reads with low quality: | 1.207510 M (2.305391%) |
| reads with too many N: | 29.044000 K (0.055451%) |
| reads too short: | 18.224000 K (0.034793%) |
| reads with adapter dimer: | 0 (0.000000%) |
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Adapter or bad ligation of read1
The input has little adapter percentage (~0.044295%), probably it's trimmed before.
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Adapter or bad ligation of read2
The input has little adapter percentage (~0.047007%), probably it's trimmed before.
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Value of each position will be shown on mouse over.
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Darker background means larger counts. The count will be shown on mouse over.
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Darker background means larger counts. The count will be shown on mouse over.
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