FastQCFastQC Report
Fri 24 Oct 2025
barcode39.fastq.gz

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
Filenamebarcode39.fastq.gz
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences150
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length17-13125
%GC50

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[WARN]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[WARN]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[FAIL]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
AAGGTTAACCACAGTGTCAACTAGAGCCTCTCCAGCACCTAAGGTTAACC3624.0No Hit
AAGGTTAACCACAGTGTCAACTAGAGCCTCTCCAGCACC1812.0No Hit
GGTGCTGGAGAGGCTCTAGTTGACACTGTGGTTAACCTTAAGGTTAACCA85.333333333333334No Hit
TAAGGTTAACCACAGTGTCAACTAGAGCCTCTCCAGCACC85.333333333333334No Hit
AAGGTTAACCACAGTGTCAACTAGAGCCTCTCCAGCACCAAGGTTAACCA74.666666666666667No Hit
GGTGCTGGAGAGGCTCTAGTTGACACTGTGGTTAACCTT42.666666666666667No Hit
TAAGGTTAACCACAGTGTCAACTAGAGCCTCTCCA42.666666666666667No Hit
GGTGCTGGAGAGGCTCTAGTTGACACTGTGGTTAACCTTAGGTGCTGGAG42.666666666666667No Hit
AAGGTTAACCACAGTGTCAACTAGAGCCTCTCCAGCACCTGGTGCTGGAG32.0No Hit
GGTGCTGGAGAGGCTCTAGTTGACACTGTGGTTAACCACAGTGTCAACTA21.3333333333333335No Hit
AAGGTTAACCACAGTGTCAACTAGAGCCTCTCCAGCACCGGTGCTGGAGA21.3333333333333335No Hit
AAGGTTAACCACAGTGTCAACTAGAGCCTCTCCAGCACCT21.3333333333333335No Hit
TAAGGTTAACCACAGTGTCAACTAGAGCCTCTCC21.3333333333333335No Hit
AAGGTTAACCACAGTGTCAACTAGAGCCTCTCCAGCAC21.3333333333333335No Hit
GGTGCTGGAGAGGCTCTAGTTGACACTGTGGTTAACCTTGGTGCTGGAGA10.6666666666666667No Hit
GGTGCTGGAGAGGCTCTAGTTGACACTGTGGTTAACCTTAGGTGCTGGAGAGGCTCTAGTTGACACTGTA10.6666666666666667No Hit
GTGTAGTCTACTTGGTTCGGTTGCGTATAGGTTAACCACAGTGTAAGCTCCAGAGCCTCTCCAGCACC10.6666666666666667No Hit
AAGGTTAACCACAGTGTCAACTAGAGCCTCTCCAGCACCAGTGCTGGAGA10.6666666666666667No Hit
TTCAGATAACTTGAAAA10.6666666666666667No Hit
GGTGCTGGAGAGGCTCTAGTTGGTTAACCT10.6666666666666667No Hit
CATGGATAGAGGCGAACAAGAAGTCGTTGGCACTCTGTGCGA10.6666666666666667No Hit
TAAGGTTAACCAAGTGTCAACTAGAGCCTCTCCAGCACC10.6666666666666667No Hit
AAGGTTAACCACAGTGTCAACTAGAGCCTCTCGGTGCTGGAGAGGCTCTA10.6666666666666667No Hit
GGTGCTGGAGAGGCTCTAGTTGACACTGTGGTTAACCTCCAGTGCTGGAG10.6666666666666667No Hit
AAGGTTAACCACAGTGTCAACTAGAGCCTC10.6666666666666667No Hit
AGTGCTGGAGAGGCTGTAGTGGCACTGTGGTGGGCCTTCATCTGGAGAGG10.6666666666666667No Hit
AAGGTTAACCACAGTGTCAACTAGAGCCTCT10.6666666666666667No Hit
GCTGCCGCTATGGATGAATTGTACACACAATACCGCCAGGTGTTAGCAGG10.6666666666666667No Hit
AGGTGCTGGAGAGGCTCTAGTTGACACTGTGGTTAACCTTAGGTGCTGGA10.6666666666666667No Hit
AAGGTTAACCACAGTGTCAACTAGAGCCTCTCCGGCACCAGGTGCTGGAG10.6666666666666667No Hit
AAGGTTAACCACAGTGTCAACTAGAGCCTCTCCAGCACCAGGTGCTGGAG10.6666666666666667No Hit
CAAGGTTAACCACAGTGTCAACTAGAGCCTCTCCAGCACCTAAGGTTAAC10.6666666666666667No Hit
AAGGTTAACCACAGTGTCAACTAGAGCCTCTCCAGCTCACCACAGTGCTG10.6666666666666667No Hit
GCTGGAGAGGCTCTAGTTGACACTGTGGTTAACCTTAGGTGCTGGAGAGG10.6666666666666667No Hit
AAGGTTAACCACAGTGTCAACTAGAGCCTCTCCAGCACCTAAGGTTAACCACAGTGTCAACTAGAGCCTCTCCA10.6666666666666667No Hit
AAGGTTGACCACAGTGTCAACTGAGGCCTCTCCAGCACCTAAGGTTGACC10.6666666666666667No Hit
TAAGGTTAACCACAGTATCAACTAGAGCCTCTCCAGCACC10.6666666666666667No Hit
ATGTTTATGCCCAGCACCCCTTCAACAGTCATCTGCTAAGGTTAACCAAA10.6666666666666667No Hit
GGTGCTGGAGAGGCTCTAGTTGACACTGTGGTTAACCTTAAGGTTAACCT10.6666666666666667No Hit
AAGGTTAACCACAGTGTCAACTAGAGCCTCTCCAGCACCAAGGTTAACCACAGTGTCAACTAGAGCCTCTCCA10.6666666666666667No Hit
GGAGAGGCTCTAGTTGACACTGTGGTTAACCTTAAGGTTAACCACAGTGT10.6666666666666667No Hit
AAGGTTAACCACAGTGTCAACTAGAGCCTCTCCAGCACCTCCTCAAAACT10.6666666666666667No Hit
AAGGTTAACCACAGTGTCAACTAGAGCCTCTCCAGCACCAAGGTTAACTAGAGCCTCTCCAGCACC10.6666666666666667No Hit
TAAGGTTAACCAGGGTGTCAACTAGAGCCTCTCCAGCACC10.6666666666666667No Hit
TTGCATGCCTTGACTGAGTTACGTATTGCTAAGGTTAACCACAGTGTCAACTAGAGCCTCTCCAGCACC10.6666666666666667No Hit
GTTTTGTTAACTCTTGGTTCAGTTAGTACTACACAGGTTAACCACAGTGT10.6666666666666667No Hit
AGCACCAAGGTTAACCACAGTGTCAACTAGAGCCTCTCCAGCACAAAAAA10.6666666666666667No Hit
AAGGTTAACCACAGTGTCAACTAGAGCCTCTCCAGC10.6666666666666667No Hit
GGTGCTGGAGAGGCTCTAGTTGACACTGTGGTTAACCTTCCTTTACCCTT10.6666666666666667No Hit
GGTGCTAGAGGCTCTAGTTGACACTGTGGTTAACCTTAAGGTTAACCACA10.6666666666666667No Hit
GGTGCTGGAGAGGCTCTAGTTGACACTGTGGTTAACTTTGGTGCTGGAGAGGCTCTAGTTGACACTGTGT10.6666666666666667No Hit
AGGTTAACCACAGTGTCAACTAGAGCCTCTCCAGCACCAAGGTTAACCAC10.6666666666666667No Hit
TAAGGTTAACCACAGTGTCAACTAGAGCCTCTCCAGCAC10.6666666666666667No Hit
AAGGTTAACCACAGTGTCAACTAGAGCCTCTCCAGAAGGTTAACCACAGTGTCAACTAG10.6666666666666667No Hit
TAAGGTTAACCACAGTGTCAACTAGAGCCTCTCCAG10.6666666666666667No Hit
CAGGTTAACCACAGTGTGACTAGAGCCTCTCCAGCACAGATGCTGGAGGCTCTGGTCACACTGTGGTTAACCTT10.6666666666666667No Hit
GGTGCTGGAGAGGCTCTGTAGTTGACACTGTGGTTAACCTT10.6666666666666667No Hit
AAGGTTAACCACAGTGTCAACTAGAGCCTCTCCAGCACCTCTAAAAACCT10.6666666666666667No Hit
AAGGTTAACCACAGTGTCAACTAGAGCCTCTCCAAGGTTAACCACAGTGT10.6666666666666667No Hit
GGAGAGGCTCTAGTTGACACTGTGGTTAACCTTGGTGCTGGAGAGGCTCTAGTTGACACTGTGGTTAACCTTA10.6666666666666667No Hit
GGTGCTGGAGGCTCTGGTTTGACACTGTGGTTAACCTTAGGTCTGGAGGC10.6666666666666667No Hit
GATGGTAATTCTGACCGGCGGAATCAACCTTTCCGTGGGAGGGACTTTGG10.6666666666666667No Hit

[OK]Adapter Content

Adapter graph

Produced by FastQC (version 0.11.9)